在那遙遠(yuǎn)的宇宙那一邊，來(lái)自未知世界的威脅正在步步逼近，恐怖的侵略魔爪正在向地球襲來(lái)……西歷2000年，伴隨著人類科學(xué)的不斷發(fā)展，人類迎來(lái)了憑借“G反應(yīng)機(jī)關(guān)”獲得夢(mèng)之能源的光輝代。在首都メトロポリタン與紐約之間的的夢(mèng)幻子彈列車“閃電號(hào)“（時(shí)速500公里，行程1.5小時(shí)）的開(kāi)通式上，素不相識(shí)的比利·其姆拉，貝尼·卡特和羅塔3人被卷入了不可思議的事件之中——就在眼前的“閃電號(hào)”列車居然在彩虹色光芒的包圍下之消失了……比利和貝尼開(kāi)始追查事件緣由，經(jīng)過(guò)調(diào)查，他們發(fā)現(xiàn)世界各地都發(fā)生了同樣的蒸發(fā)事件，事實(shí)真相被不置可否地掩蓋，人們?cè)谕耆恢劳{即將來(lái)臨的情況下不明就里地生活著。國(guó)連為了查明原因，設(shè)立了極秘的地球防衛(wèi)組織“迷宮機(jī)關(guān)”，與即將發(fā)生的恐怖事件相對(duì)抗。在偶然的機(jī)會(huì)下，比利和貝尼開(kāi)始與“迷宮機(jī)關(guān)”共同行動(dòng)，二位少年與迷之宇宙人戰(zhàn)斗的超特作科學(xué)冒險(xiǎn)物語(yǔ)就此展開(kāi)……